Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms