Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD6

Pfn3, Profilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn3Q9DAD6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfn3Q9DAD6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfn3Q9DAD6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms