Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smco2Q9DA21 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms