Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sgf29Q9DA08 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms