Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms