Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Calr3Q9D9Q6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms