Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Pdzd9Q9D9M4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Pdzd9Q9D9M4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Pdzd9Q9D9M4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Pdzd9Q9D9M4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Pdzd9Q9D9M4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Pdzd9Q9D9M4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Pdzd9Q9D9M4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Pdzd9Q9D9M4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd9Q9D9M4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd9Q9D9M4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd9Q9D9M4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd9Q9D9M4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd9Q9D9M4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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