Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D9H8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D9H8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D9H8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D9H8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D9H8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9D9H8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D9H8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D9H8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D9H8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D9H8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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