Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9E9

1700086D15Rik, RIKEN cDNA 1700086D15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700086D15RikQ9D9E9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700086D15RikQ9D9E9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700086D15RikQ9D9E9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms