Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cntd1Q9D995 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntd1Q9D995 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntd1Q9D995 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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