Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms