Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms