Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms