Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms