Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms