Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4cQ9D7F7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4cQ9D7F7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4cQ9D7F7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4cQ9D7F7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4cQ9D7F7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4cQ9D7F7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4cQ9D7F7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4cQ9D7F7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4cQ9D7F7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4cQ9D7F7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4cQ9D7F7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4cQ9D7F7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4cQ9D7F7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4cQ9D7F7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp4cQ9D7F7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms