Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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