Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms