Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms