Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms