Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms