Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms