Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms