Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tomm20lQ9D4V6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms