Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf6Q9D4J7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf6Q9D4J7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms