Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D5

4933414I15Rik, RIKEN cDNA 4933414I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933414I15RikQ9D4D5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4933414I15RikQ9D4D5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms