Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cfap53Q9D439 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cfap53Q9D439 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cfap53Q9D439 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms