Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms