Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms