Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms