Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms