Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spns3Q9D232 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms