Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H0

Rita1, RBPJ-interacting and tubulin-associated protein 1, mousemouse

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rita1Q9D1H0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rita1Q9D1H0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rita1Q9D1H0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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