Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms