Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TbcbQ9D1E6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TbcbQ9D1E6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TbcbQ9D1E6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TbcbQ9D1E6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TbcbQ9D1E6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TbcbQ9D1E6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TbcbQ9D1E6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TbcbQ9D1E6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TbcbQ9D1E6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TbcbQ9D1E6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TbcbQ9D1E6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TbcbQ9D1E6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TbcbQ9D1E6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms