Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms