Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl52Q9D0Y8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl52Q9D0Y8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms