Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Zbed3Q9D0L1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Zbed3Q9D0L1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Zbed3Q9D0L1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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