Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NkapQ9D0F4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NkapQ9D0F4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms