Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms