Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms