Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZG3

Commd8, COMM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd8Q9CZG3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd8Q9CZG3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms