Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY73

Mrpl44, 39S ribosomal protein L44, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl44Q9CY73 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl44Q9CY73 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl44Q9CY73 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl44Q9CY73 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl44Q9CY73 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl44Q9CY73 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl44Q9CY73 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl44Q9CY73 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms