Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yif1bQ9CX30 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms