Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ist1Q9CX00 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ist1Q9CX00 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms