Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms