Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWB5

Pgpep1l, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1lQ9CWB5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pgpep1lQ9CWB5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pgpep1lQ9CWB5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms