Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINDY3Q9CV28 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms