Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms