Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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